—Where ________ my glasses?—They ________ on your desk....

根据句子的语法结构，第一句‘Where ________ my glasses?’ 询问的是‘我的眼镜在哪里’，‘glasses’是复数名词，所以下文应使用‘are’。第二句‘They ________ on your desk.’ 这里‘they’指代的是复数的‘glasses’，因此也应该用‘are’。